Ursprünglich wurden acht IZKFs im Rahmen des Programms „Gesundheitsforschung 2000“ des Bundesministeriums für Forschung und Technologie über einen Zeitraum von jeweils 8 Jahren gefördert.
Das IZKF Jena wurde nachträglich in den IZKF-Verbund aufgenommen. Einige IZKFs wurden mittlerweile in übergeordnete Fakultätsstrukturen überführt.
